Институт Экономики, занимает особое место в структуре НАНА, сделав большие вклады и пройдя достойный исторический путь развития.
В 1935 году Институт Экономики был в составе Азербайджанского филиала Академии Наук СССР, в 1935 году в составе секторов Экономики и Географии, а в 1945 году стал уже функционировать на основе базы Экономического сектора Азербайджанской ССР.
В период деятельности института (1958-1960-е года) функционировали 5 отделов: «Политическая экономика и экономическая мысль», «Экономика промышленности», «Экономика сельского хозяйства», «Размещение социалистического производства» и «История народного хозяйства». В последующие годы (1961-1965, 1966-1970, 1971-1985, 1986-1990 года) деятельность Института была направлена на выполнение научно-исследовательских работ определяемые со стороны государства и органов управления в наиболее проблемных секторах экономики.
Приобретая независимость 18 октября 1991 года - Азербайджан перешел на рыночную экономику. Тем самым экономика страны перешла на новый этап научного развития и перед Институтом Экономики были поставлены новые задачи. В период независимости Институт Экономики НАНА успешно выполнял научно-исследовательские работы в сфере развития и формирования национальной экономики независимого Азербайджана. Так же надо отметить большие заслуги в подготовке специалистов в области экономики.
На диссертационном Совете Специализированных Докторов и Кандидатов, функционирующий на протяжении многих лет, были защищены свыше 850 кандидатских, около 100 докторских диссертационных работ. Были изданы свыше 1500 монографий и книг.
По решению Президиума НАНА от 26 ноября 2008 года (указ № 23/11) в составе Института Экономики НАНА были созданы 13 отделов:
1.«Экономическая теория и история экономической мысли»
2.«Макроэкономическое развитие и экономический рост»
3.«Политика промышленности и инвестиционные проблемы»
4.«Демография и проблемы воспроизводства рабочей силы »
5.«Аграрные реформы и проблемы продовольственной безопасности»
6.«Предпринимательство и проблемы регулирования монополией»
7.«Глобализация и международные экономические отношения»
8.«Развитие регионов и проблемы использования природных ресурсов»
9.«Финансы, денежно-кредитная политика»
10.«Инновационный менеджмент и проблемы развития науки»
11.«Аналитическая информация и издательство»
12.«Социально-экономические проблемы уровня жизни»
13.«Проблемы развития обслуживающих отраслей»
Научно-исследовательские работы при Институте по сей день продолжают свою научную деятельность в соответствующих отделах. На данный момент в Институте Экономики НАНА работают 185 человек. Двое из сотрудников являются членами-корреспондентами Института Экономики НАНА, 22 – докторами экономических наук, 60 докторов философии экономических наук.
Со дня создания Института Экономики в 1958 году по 1964 год директором был кандидат экономических наук Г.Т.Гусейнов, с 1964-1989 года академик А.А. Махмудов, с 1991-1998 годах - член-корреспондент НАНА, доктор экономических наук, профессор А.К. Алескеров, с января 1999 года по июнь 2008 года - член-корреспондент Института Экономики НАНА доктор экономических наук, профессор Ш.М.Мурадов, с июня 2008 года по май 2014 года доктор экономических наук, профессор И.Н.Алыев, с мая 2014 года Институтом Экономики руководит доктор экономических наук, профессор Назим Музаффарлы (Иманов).
